Определение понятий «систематика» и «таксономия». Категории таксономии: царство, тип, класс, порядок, семейство, род, вид, подвид, штамм. Концепция вида у прокариот. Понятия «клон», «штамм», «вариант» (морфовары, серовары, фаговары, резистенсвары, патовары). Вариант как инфравидовая систематическая категория. Номенклатура бактерий. Международный кодекс номенклатуры бактерий. Классификация прокариот. Искусственные классификации. Эволюционная систематика. Филогенетическая классификация. Филогенетическая систематика К.Везе. Три империи живых организмов: Eukaryota, Archaeobacteria, Eubacteria. Эволюционные линии домена Archaea. Основные эволюционные ветви домена Bacteria. Геносистематика. Хемотаксономия.
Идентификация бактерий. Морфологические, тинкториальные, культуральные, физиолого-биохимические, серологические признаки. Систематика бактерий на основе генетического родства. 16S р-РНК система идентификации. Использование хемотаксономических признаков для идентификации.
Принципы систематизации прокариот в определителе Берджи (Берджи, 1994).
Категория 1. Грамотрицательные эубактерии, имеющие клеточную стенку. Группа 1. Спирохеты.
Категория 1. Грамотрицательные эубактерии, имеющие клеточную стенку. Группа 2. Изогнутые палочки и спириллы.
Категория 1. Грамотрицательные эубактерии, имеющие клеточную стенку. Группа 3. Неподвижные изогнутые палочки «микроциклусы».
Категория 1. Грамотрицательные эубактерии, имеющие клеточную стенку.Группа 4. Грамотрицательные палочки и кокки.
Категория 1. Грамотрицательные эубактерии, имеющие клеточную стенку. Группа 12. Аэробные хемолитоавтортрофные эубактерии (тионовые бактерии, нитрифицирующие бактерии, железобактерии, магнитные бактерии).
Категория 1. Грамотрицательные эубактерии, имеющие клеточную стенку. Группа 13. Почкующиеся бактерии и простекобактерии.
Категория 1. Грамотрицательные эубактерии, имеющие клеточную стенку. Группа 14. Бактерии, обладающие чехлом.
Категория 1. Грамотрицательные эубактерии, имеющие клеточную стенку. Группа 15. Скользящие бактерии.
Категория 1. Грамотрицательные эубактерии, имеющие клеточную стенку.Группа 16. Миксобактерии.
Категория 2. Грамположительные эубактерии, имеющие клеточную стенку. Группа 17. Грамположительные кокки.
Категория 2. Грамположительные эубактерии, имеющие клеточную стенку.Группа 18. Грамположительные палочки и кокки, образующие эндоспоры.
Категория 2. Грамположительные эубактерии, имеющие клеточную стенку. Группа 19. Грамположительные неспорообразующие палочки правильной формы.
Категория 2. Грамположительные эубактерии, имеющие клеточную стенку. Группа 20. Грамположительные неспорообразующие палочки неправильной формы.
Категория 2. Грамположительные эубактерии, имеющие клеточную стенку.Группа 21. Микобактерии.
Категория 2. Грамположительные эубактерии, имеющие клеточную стенку.Группы 22-29. Актиномицеты.
Категория 3. Эубактерии, лишенные клеточной стенки. Группа 30. Микоплазмы.
Категория 4. Архебактерии. Отличия архебактерий от эубактерий. Группа 31. Метаногены. Группа 33. Экстремальные галофилы. Группа 35. Экстремальные термофилы и гипертермофилы.
ЛИТЕРАТУРА
1. Гусев М.В., Минеева Л.А. Микробиология. - М.: Академия, 2003. - 463 с.
2. Емцев В.Т., Мишустин Е.Н. Микробиология. - М.: Дрофа, 2005.- 445 с.
3. Определитель бактерий Берджи / Под ред. Дж.Хоулта, Н Крига, П.Снита. М.: Мир, 1997. В 2-х т.