Будь умным!

У вас вопросы?
У нас ответы:) SamZan.net

Тема занятия Молекулярное клонирование

Работа добавлена на сайт samzan.net:

Поможем написать учебную работу

Если у вас возникли сложности с курсовой, контрольной, дипломной, рефератом, отчетом по практике, научно-исследовательской и любой другой работой - мы готовы помочь.

Предоплата всего

от 25%

Подписываем

договор

Имя

Выберите тип работы:

Принимаю Политику конфиденциальности

Скидка 25% при заказе до 25.11.2024

ФИО	Шонина Мария Юрьевна
Занятие №	3		Дата:	2013.10.30
Тема занятия	Молекулярное клонирование. Ферменты рестрикции: параметры и условия работы
Вариант	2
№ PC	11

Исходные данные:

Концентрация ДНК 200 ng/µl, для рестрикции используем 500 ng;

Рекомендуемый объем реакционной смеси 20 µl;

Вариант 2

Задание 1

1) GsuI + BglII

Наименование ферментов в задании	GsuI + BglII
Наименование ферментов по каталогу Fermentas	BpmI+ BglII
Краткая характеристика ферментов
Название, оптимальная температура	Сайт рестрикции	Условия инактивации	Рекомендуемый буффер для 100% активности	B	G	O	R	Y 1x	Y 2x
GsuI (BpmI) 30°C	C T G G A G (N)16↓	65оС – 20 мин	B (Blue)	100	50-100	0-20	20-50	100	50-100
BglII 37оС	A↓G A T C T	ЭДТА до 20 мМ; “переосаждение”	O (Orange)	0-20	20-50	100	50-100	0-20	100

Можно использовать буферную систему TangoTM Yellow 2x (GsuI, BglII)

Протокол рестрикции

Наименование реагента	Исходная концентрация	Желаемое количество/концентрация в конечном растворе	Объем реактива (добавляемый в пробирку)
ДНК	200 ng/µl	500 ng	2,5 µl
Буфер Yellow ТangoTM	10 X	2X	2,5 µl
Рестриктаза GsuI (BpmI)	5 u/µl	1 u (2X)	0,2 µl
H2O		до 20 µl	14,8 µl
Условия реакции: 30°C 1 час. Реакционную смесь нагреть до 37°C и к реакционной смеси добавить:

Буфер Yellow ТangoTM	10 X	2X	2,5 µl
Рестриктаза BglII	10 u/µl	0,5 u (1X), физически добавляем 1 u	0,1 µl
Условия реакции: 37°C 1 час. Для инактивации ферментов можно использовать переосаждение ДНК.

2) TaiI + EcoR32I

Наименование ферментов в задании	TaiI + EcoR32I
Наименование ферментов по каталогу Fermentas	MaeII + EcoRV
Краткая характеристика ферментов
Название, оптимальная температура	Сайт рестрикции	Условия инактивации	Рекомендуемый буффер для 100% активности	B	G	O	R	Y 1x	Y 2x
TaiI (MaeII) 65°C	A C G T↓	ЭДТА до 20 мМ; “переосаж-дение”	R (red)	50-100	50-100	20-50	100	100	50-100
EcoR32I (EcoRV) 37°C	G A T↓A T C	80°C 20 мин	R (red)	0-20	50-100	50-100	100	20-50	100

Можно использовать буферную систему R (red) (TaiI, EcoR32I)

Протокол рестрикции

Наименование реагента	Исходная концентрация	Желаемое количество/концентрация в конечном растворе	Объем реактива (добавляемый в пробирку)
ДНК	200 ng/µl	500 ng	2,5 µl
Буфер R (red)	10 X	1X	2,0 µl
Рестриктаза TaiI (MaeII)	10 u/µl	0,5 u (1X), физически добавляем 1 u	0,1 µl
H2O		до 20 µl	15,4 µl
Условия реакции: 65°C 1 час. Реакционную смесь охладить до 37°C и к реакционной смеси добавить:

Буфер R (red)	10 X	1X	2,0 µl
Рестриктаза EcoR32I (EcoRV)	10 u/µl	0,5 u (1X), физически добавляем 1 u	0,1 µl
Условия реакции: 37°C 1 час. Для инактивации ферментов можно использовать переосаждение ДНК.

3) HindIII + SmaI

Наименование ферментов в задании	HindIII + SmaI
Наименование ферментов по каталогу Fermentas	TaaI + BspTI
Краткая характеристика ферментов
Название, оптимальная температура	Сайт рестрикции	Условия инактивации	Рекомендуемый буффер для 100% активности	B	G	O	R	Y 1x	Y 2x
HindIII 37°C	A↓A G C T T	80 оС – 20 мин	R (Red)	0-20	20-50	0-20	100	50-100	50-100
SmaI 30°C	C C C↓G G G	65°C 20 мин	Tango	50-100	0-20	0-20	0-20	100	0-20

Можно использовать буферную систему TangoTM Yellow 1x (HindIII, SmaI)

Протокол рестрикции

Наименование реагента	Исходная концентрация	Желаемое количество/концентрация в конечном растворе	Объем реактива (добавляемый в пробирку)
ДНК	200 ng/µl	500 ng	2,5 µl
Буфер Yellow ТangoTM	10 X	1X	2,0 µl
Рестриктаза HindIII	10 u/µl	1 u (2X)	0,1 µl
H2O		до 20 µl	15,4 µl
Условия реакции: 37°C 1 час. Реакционную смесь охладить до 30°C и к реакционной смеси добавить:

Буфер Yellow ТangoTM	10 X	1X	2,0 µl
Рестриктаза SmaI	10 u/µl	0,5 u (1X), физически добавляем 1 u	0,1 µl
Условия реакции: 30°C 1 час. Для инактивации ферментов можно использовать нагревание до 65 оС – 20 минут.

4) TaaI + Bst1107I

Наименование ферментов в задании	TaaI + Bst1107I
Наименование ферментов по каталогу Fermentas	HpyCH4III + BstZ17I
Краткая характеристика ферментов
Название, оптимальная температура	Сайт рестрикции	Условия инактивации	Рекомендуемый буффер для 100% активности	B	G	O	R	Y 1x	Y 2x
TaaI (HpyCH4III) 65°C	ACN ↓GT	ЭДТА до 20 мМ; “переосаж-дение”	TangoTM	0-20	0-20	0-20	50-100	100	20-50
Bst1107I BstZ17I 37°C	G T A↓T A C	80°C 20 мин	O	20-50	50-100	100	100	0-20	100

Можно использовать буферную R (Red) (TaaI, Bst1107I)

Протокол рестрикции

Наименование реагента	Исходная концентрация	Желаемое количество/концентрация в конечном растворе	Объем реактива (добавляемый в пробирку)
ДНК	200 ng/µl	500 ng	2,5 µl
Буфер R (Red)	10 X	1X	2,0 µl
Рестриктаза TaaI (HpyCH4III)	10 u/µl	1u (2X)	0,1 µl
H2O		до 20 µl	15,4 µl
Условия реакции: 65°C 1 час. Реакционную смесь охладить до 37°C и к реакционной смеси добавить:

Буфер R (Red)	10 X	1X	2,0 µl
Рестриктаза Bst1107I (BstZ17I)	10 u/µl	0,5 u (1X), физически добавляем 1 u	0,1 µl
Условия реакции: 37°C 1 час. Для инактивации ферментов можно использовать переосаждение ДНК.

Задание 2

1) EcoRI + HindIII

Наименование ферментов в задании	EcoRI + HindIII
Наименование ферментов по каталогу Fermentas	EcoRI + HindIII
Краткая характеристика ферментов
Название, оптимальная температура	Сайт рестрикции	Условия инактивации	Рекомендуемый буффер для 100% активности	B	G	O	R	Y 1x	Y 2x
EcoRI 37°C	G↓A A T T C	65°C 20 мин	EcoRI Buffer [Unique]	0-20	NR	100	100	NR	100
HindIII 37°C	A↓A G C T T	80°C 20 мин	R (Red)	0-20	20-50	0-20	100	50-100	50-100

Можно использовать буферную систему R (Red) (EcoRI, HindIII)

Протокол рестрикции

Наименование реагента	Исходная концентрация	Желаемое количество/концентрация в конечном растворе	Объем реактива (добавляемый в пробирку)
ДНК	200 ng/µl	500 ng	2,5 µl
Буфер R (Red)	10 X	1X	2,0 µl
Рестриктаза EcoRI	10 u/µl	0,5 u (1X), физически добавляем 1 u	0,1 µl
H2O		до 20 µl	15, 4 µl
Условия реакции: 37°C 1 час. К реакционной смеси добавить:

Буфер R (Red)	10 X	1X	2,0 µl
Рестриктаза HindIII	10 u/µl	0,5 u (1X), физически добавляем 1 u	0,1 µl
Условия реакции: 37°C 1 час. Для инактивации ферментов можно использовать нагревание до 65 оС.

2) MboI + BamHI

Наименование ферментов в задании	MboI + BamHI
Наименование ферментов по каталогу Fermentas	MboI + BamHI
Краткая характеристика ферментов
Название, оптимальная температура	Сайт рестрикции	Условия инактивации	Рекомендуемый буффер для 100% активности	B	G	O	R	Y 1x	Y 2x
MboI 37°C	↓G A T C	65°C 20 мин”	R (Red)	50-100	50-100	50-100	100	50-100	100
BamHI 37°C	G↓G A T C C	80°C 20 мин	BamHI Buffer (Unique)	20-50	100	20-50	50-100	100	50-100

Можно использовать буферную систему R (Red) (MboI, BamHI)

Протокол рестрикции

Наименование реагента	Исходная концентрация	Желаемое количество/концентрация в конечном растворе	Объем реактива (добавляемый в пробирку)
ДНК	200 ng/µl	500 ng	2,5 µl
Буфер R (Red)	10 X	1X	2,0 µl
Рестриктаза MboI	10 u/µl	0,5 u (1X), физически добавляем 1 u	0,1 µl
H2O		до 20 µl	15, 4 µl
Условия реакции: 37°C 1 час. К реакционной смеси добавить:

Буфер R (Red)	10 X	1X	2,0 µl
Рестриктаза BamHI	10 u/µl	1 u (2X)	0,1 µl
Условия реакции: 37°C 1 час. Для инактивации ферментов можно использовать нагревание 65оС – 20 минут.

3) ScaI + PstI

Наименование ферментов в задании	ScaI + PstI
Наименование ферментов по каталогу Fermentas	ScaI + PstI
Краткая характеристика ферментов
Название, оптимальная температура	Сайт рестрикции	Условия инактивации	Рекомендуемый буффер для 100% активности	B	G	O	R	Y 1x	Y 2x
ScaI 37°C	A G T↓A C T	80°C 20 мин	ScaI Buffer (Unique)	0-20	0-20	0-20	0-20	0-20	0-20
PstI 37°C	C T G C A↓G	ЭДТА до 20 мМ; “переосаж-дение”	O	50-100	50-100	100	100	50-100	50-100

Можно использовать буферную систему O (Orange) (ScaI, PstI)

Протокол рестрикции

Наименование реагента	Исходная концентрация	Желаемое количество/концентрация в конечном растворе	Объем реактива (добавляемый в пробирку)
ДНК	200 ng/µl	500 ng	2,5 µl
Буфер O (Orange)	10 X	1X	2,0 µl
Рестриктаза ScaI	10 u/µl	2,5 u (5X)	0,25 µl
H2O		до 20 µl	15,25 µl
Условия реакции: 37°C 1 час. К реакционной смеси добавить:

Буфер O (Orange)	10 X	1X	2,0 µl
Рестриктаза PstI	10 u/µl	0,5 u (1X), физически добавляем 1 u	0,1 µl
Условия реакции: 37°C 1 час. Для инактивации ферментов можно использовать переосаждение ДНК.

4) Cfr10I + PvuI

Наименование ферментов в задании	Cfr10I + PvuI
Наименование ферментов по каталогу Fermentas	BsrFI+ PvuI
Краткая характеристика ферментов
Название, оптимальная температура	Сайт рестрикции	Условия инактивации	Рекомендуемый буффер для 100% активности	B	G	O	R	Y 1x	Y 2x
Cfr10I (BsrFI) 37°C	R↓C C G G Y	ЭДТА до 20 мМ; “переосаж-дение”	Cfr10I Buffer [Unique]	0-20	20-50	20-50	50-100	20-50	50-100
PvuI 37°C	C G A T↓C G	80°C 20 мин	R (Red)	0-20	20-50	50-100	100	50-100	100

Можно использовать буферную систему R (Red) 1x (Cfr10I, PvuI)

Протокол рестрикции

Наименование реагента	Исходная концентрация	Желаемое количество/концентрация в конечном растворе	Объем реактива (добавляемый в пробирку)
ДНК	200 ng/µl	500 ng	2,5 µl
Буфер R (Red)	10 X	1X	2,0 µl
Рестриктаза Cfr10I (BsrFI)	10 u/µl	1 u (2X)	0,1 µl
H2O		до 20 µl	15,4 µl
Условия реакции: 37°C 1 час. К реакционной смеси добавить:

Буфер R (Red)	10 X	1X	2,0 µl
Рестриктаза PvuI	10 u/µl	0,5 u (1X), физически добавляем 1 u	0,1 µl
Условия реакции: 37°C 1 час. Для инактивации ферментов можно использовать переосаждение ДНК.

1. За 4 роки окупації на значній території країни було зруйновано 210 тис
2. на тему- Философия возрождения Выполнил студент 1го курса РГППУ ЭП101- Гайнутдинов И
3. тематики в 3 классе по теме Случаи деления когда делитель больше делимого Подготовила Учител
4. Понятно почему- какое уж тут одиночество если вдруг встретились два пешехода один как известно шел из
5. Система элективных курсов по информатике для предпрофильной подготовки Компьютерная и информационная безопасность
6. Ференц Надь
7. Чем больше углубляется расчленение технологических процессов тем настоятельнее становится необходимость
8. а Коли виникло нотне письмо 14ст Автор першої класичної української симфонії Левко Ревуцький Осн
9. е что говорить по телефону
10. і. Поняття земельного угіддя в земельному кадастрі
11. Гоголь Старосветские помещики
12. 2013 г. Вопросы к экзамену по дисциплине Организация планирование и управление производс
13. Тема 2. Культура как система 1.html
14. Специальные вопросы финансового менеджмента
15. НОВАЯ ВОЛНА ИСПАНСКИХ ИНВЕСТИЦИЙ В РЕГИОН Увеличение масштабов вывоза испанского капитала в страны регио
16. Субъекты и объекты гражданских правоотношений
17. Болезни цивилизации
18. теорію революційного перетворення буржуазного суспільства в соціалістичне і комуністичне т
19. юридическо
20. ВАРІАНТ 1 1 Бактерії їх морфологія

Материалы собраны группой SamZan и находятся в свободном доступе